ر ابتدا باید روی صندلی مخصوصی بنشینید. ابزار هایی روی سر شما قرار می گیرند که امکان ایجاد میدان مغناطیسی را فراهم می کنند. این تحریکات الکتریکی باعث می شود که تمامی نورون های مغزی در یک ناحیه خاص درگیر شوند و فعالیت های کوتاه مدتی داشته باشند. تحریک یا بازداری از فعالیت های مختلف مغزی باعث می شود که بسیاری از مهم ترین بیماری های روحی و روانی درمان شود. برای استفاده از آر تی ام اس یا تحریک مغناطیسی مغز نیاز به مراقبت های قبلی نیست فقط از شما خواسته می شود که اشیا حساس مانند جواهرات موبایل و کارتهای اعتباری را از خود دور کنید. اگر طلا و جواهر دارید قبل از حاضر شدن در کلینیک آن را کنار بگذارید. بیمار روی یک صندلی می نشیند و دستگاه روی منطقه مورد نظر مغز قرار داده می شود .سپس فراینده تولید فرکانس و ارسال به مغز انجام می شود .با توجه به اختلال و آسیبی که به مغز وارد شده است درجه ی مناسبی از دستگاه برای فرد تنظیم شده و عملکرد آن نسبت به شرایط بیمار تعیین می شود انجام این روش ممکن است یک تا چند جلسه به طول بیانجامد که توسط زوانپزشک و یا متخصص مغز و اعصاب جلسات مورد نیاز برای شما تعیین می شود.